「チャレンジバトル」は「詰めスパロボ」と「ＳＲポイント獲得への挑戦」を合わせた戦略＆戦術性を重視した戦闘マップになっている。各ミッションはシナリオ風に味付けされた状況が設定されており、予め与えられた資金やＰＰ、機体やパイロットを駆使して困難な勝利条件に挑む。「ＮＯＲＭＡＬ」、「ＨＡＲＤ」、「ＥＸ−ＨＡＲＤ」という３つの難易度ランクがあり、それぞれに６本のミッションが収録されている（合計で１８本）。 また、「ＨＡＲＤ」は「ＮＯＲＭＡＬ」のミッションを、「ＥＸ−ＨＡＲＤ」は「ＨＡＲＤ」のミッションを全てクリアしないとプレイすることが出来ない。 チャレンジバトルの作戦概要画面。 各ミッションはシナリオ風に味付けされた状況が設定されている。 チャレンジバトル開始前には、新作の会話シーンが挿入される。 実際の戦闘マップ内での作戦目的。 予め与えられた資金やＰＰ、機体やパイロットを駆使して困難な勝利条件に挑む。