「スーパーロボット大戦ＯＧ」は、ＤＣ戦争からＬ５戦役までの 第１部（ORIGINAL GENERATION1）と、 インスペクター事件やシャドウミラー反乱を描く 第２部（ORIGINAL GENERATION2）に大きく二つに分かれている。 　　　 第１部と第２部のどちらからでもスタートすることが可能。 （第１部→第２部の通しプレイは可能ですが、第２部からプレイすると第１部に戻ることは出来ません）。 　　　 さらに今回は第１部と第２部の間を描く追加シナリオや、第２部以降の話を描く 新作シナリオがいくつか存在。これらの要素により、 「ORIGINAL GENERATION」初体験はもちろん、OGユーザーも今回の「OG」を楽しむことが出来る。